13 commissions spécialisées sont chargées de préparer et de donner un avis sur les dossiers de leur domaine de compétences.
Les commissions spécialisées sont chargées d’étudier et d’émettre un avis sur les affaires relevant de leurs domaines, avant qu’elles ne soient soumises au vote de l’assemblée départementale, en séance plénière.
Elles se réunissent obligatoirement avant les réunions plénières, mais elles peuvent se réunir autant que nécessaire tout au long de l'année pour réfléchir à de nouvelles politiques et procéder à des auditions de personnes extérieures reconnues pour leur expérience dans un domaine de compétence du Conseil Général.
Il y a douze commissions et une commission déléguée :
Commission des finances et des affaires générales
Président : Bernard Fischer
Commission des solidarités
Président : Frédéric Bierry
Vice-président chargé de la gérontologie : Yves Le Tallec
Commission de l’agriculture
Président : Jean Mathia
Commission de la coopération transfrontalière et décentralisée
Président : Pierre Bertrand
Commission de la culture, du patrimoine et de la mémoire
Président : Jean-Laurent Vonau
Commission du développement des territoires
Président : Richard Stoltz
Commission de l’économie, de l'emploi et du tourisme
Président : Laurent Furst
Commission de l’éducation et de la formation
Président : Marcel Bauer
Commission de l’environnement et des milieux naturels
Président : Roland Brendle
Commission des équipements et de l'aménagement durable
Président : Francis Grignon
Commission des sports
Président : Sébastien Zaegel
Commission de la jeunesse
Président : Philippe Meyer
Commission déléguée aux projets routiers
Président : André Lobstein